Dans la petite ville de Santa Clara, une orpheline de 16 ans, Salma, a passé sa vie à enquêter sur l'identité de ses parents, qu'elle n'a jamais connus. Lors de la célébration sacrée et traditionnelle annuelle du jour des morts, elle n'a aucun souvenir d'eux à mettre sur l'autel pour pouvoir les rencontrer. Avec ses frères adoptifs Jorge et Pedro, elle se lance dans une aventure pleine de fantômes et de crânes pour connaître la vérité sur son passé.
Le film raconte la vie de Jésus de Nazareth depuis sa retraite de 40 jours dans le désert, en passant par son entrée à Jérusalem, jusqu'à sa mort et au-delà.
Le film s'inspire en partie de l'enfance d'Alfonso Cuarón.
Au début des années 1970, une famille aisée vit à Mexico dans le quartier Colonia Roma . Cleo est une des domestiques d'origine indigène de cette famille avec Adela. La famille est composée des parents Sofía et Antonio, des enfants Sofi, Pepe, Toño et Paco, et de Teresa, la mère de Sofía. Sofia est quittée par son époux. Les deux femmes, Cleo et Sofia, vont s'entraider.
La campagne mexicaine. Une famille élève des taureaux de combat. Esther est en charge de la gestion du ranch, tandis que son mari Juan, poète de renommée mondiale, s’occupe des bêtes. Lorsqu’Esther s’éprend du dresseur de chevaux, Juan se révèle alors incapable de rester fidèle à ses convictions.
Alors que sa mère a disparu, Estrella trouve refuge auprès d'un groupe de quatre garçons orphelins. Effrayée par une présence étrange, la jeune fille commence à douter de ce qui l'entoure...
En apparence, Clara Barron a tout ce qui lui faut : un job, une superbe maison à Los Angeles et une famille aimante. La seule chose qui lui manque est l'amour. Se rendant à un mariage au Mexique, Clara demande à l'un de ses collègues de se faire passer pour son petit ami durant les festivités du week-end. Mais elle se retrouve nez-à-nez avec son ex... Indécise, Clara doit choisir entre son passé, ou ouvrir son coeur à de nouvelles possibilités.
Valeria, une jeune femme de 17 ans, est enceinte de Mateo, un garçon de son âge. Elle vit à Puerto Vallarta au Mexique avec Clara, sa sœur de 34 ans et avec Mateo. Valeria ne souhaitait pas que leur mère espagnole, prénommée Avril, souvent absente, soit au courant de sa grossesse. Mais le coût et la responsabilité de l'arrivée d'un enfant dans la maison décide Clara à l’appeler. Avril arrive au Mexique et s’installe chez ses filles, apparemment désireuse de les aider. Mais avec l’arrivée du bébé, son comportement change et les réticences de Valéria à lui demander de l’aide se justifient de plus en plus. Avril, à la vue des difficultés que sa fille semble avoir à endosser son rôle de mère, estime que le jeune couple n'est pas prêt psychologiquement pour assumer cet enfant. Elle élabore alors un plan.
Alejandra est mariée avec Angel et ils ont deux enfants.
Fabian, le frère d'Alejandra, travaille à l’hôpital et fait la rencontre de Veronica qui a été blessée au ventre après être allée dans la maison des Vega.
Dans une Caracas chaotique, Armando est un homme seul ayant dépassé la cinquantaine qui gère un labo de prothèses dentaires. À un arrêt de bus, il drague des jeunes garçons pour les faire venir chez lui, sans jamais les toucher. Il épie également un vieil homme avec lequel il semble avoir eu un lien traumatique. Un jour, il fait la connaissance de Élder qui commence à fréquenter Armando, d'abord pour de l'argent puis pour des raisons autres.
Moises, père de famille déterminé, fait partie d'un groupe d'immigrants clandestins mexicains entrés aux États-Unis par le désert de Sonora en Californie. Ils sont attaqués par Sam, un américain impitoyable et sans scrupules, qui les chasse sans pitié.
Arnulfo Rubio fait du trafic d'armes pour un cartel mexicain. Un agent de l'ATF, Hank Harris, veut le capturer mais se fait capturer par Rubio à la place. Lorsque ce dernier cherche à l'amener à son boss, les deux hommes commencent à sympathiser.