Un groupe de filles décide d'aller nager près de ruines sous-marines au large des côtes brésiliennes. Elles vont vite se rendre compte qu'elles ne sont pas seules sous l'eau...
Jonas Taylor est un ancien capitaine de la Marine et un plongeur spécialisé dans les eaux profondes. Il est recruté pour plonger dans l'océan Pacifique, pour sauver une équipe de scientifiques coincée dans l'épave d'un submersible attaqué et endommagé par un requin préhistorique de vingt mètres de long, connu sous le nom de Mégalodon. Engagé par un océanographe chinois, Taylor devra surmonter ses peurs et affronter une deuxième fois le prédateur qu'il a auparavant rencontré lors d'une expédition pour sauver des hommes et des femmes piégés dans les profondeurs de l'océan.
Le docteur Klaus Van Etten fait des expériences sur des requins-bouledogues sans le consentement des experts maritimes qui ne sont pas du même avis et quand ils s'échappent, évidemment c'est la panique !
À l’issue de Sharknado 5: Global Swarming (2017), la tornade de requins avait dévasté la Terre et saccagé le patrimoine de l'humanité, de la Muraille de Chine aux Pyramides d'Égypte. Humanité dont il ne restait d’ailleurs plus grand monde. Fin Shepard (Ian Ziering), se retrouvait seul, errant dans un décor de fin du monde.
Deux sœurs en vacances au Mexique sont prises au piège dans une cage d’observation de requins, au fond de l’océan. Elles n’ont que quelques heures pour remonter à la surface.
Pendant la Seconde Guerre mondiale, un navire de la Marine américaine est coulé par un sous-marin japonais, laissant 900 membres d'équipage échoués dans les eaux infestées de requins.
Partie surfer sur une plage déserte, Nancy se retrouve coincée sur un rocher à quelques mètres du rivage. Un grand requin blanc rôde dans les parages...
L'histoire se déroule cinq ans après les événements de Sharknado 3. La tempête porteuse de requins tueurs est de retour et la cible des squales est à présent Las Vegas. Après avoir ravagé la ville, le Sharknado se déplace et frappe plusieurs états du centre des États-Unis, sans façade maritime, qui n'ont pas l'habitude des cyclones se formant au-dessus de la mer, mais plutôt des tornades continentales. En se déplaçant et frappant diverses installations (barrage Hoover, champ de pétrole, transformateur électrique, centrale nucléaire), la tornade change de nature en se chargeant de matières de plus en plus dangereuses : poussières, pierres, pétrole, feu, électricité à haute tension, et même radioactivité. Toute la famille Shepard, enfin réunie, va devoir unir ses forces pour en venir à bout.
Invité à Londres par le gouvernement britannique pour participer à une conférence de l'OTAN comme spécialiste en combat contre les requins, Fin est entraîné par Nova à explorer un temple souterrain situé sous Stonehenge. Des peintures rupestres leur apprennent que l'humanité a déjà été confrontée aux Sharknado à la préhistoire, mais les humains ont conçu un artefact (en forme d'aileron dorsal de requin) pour contrôler ces tornades. En s'en emparant, Fin et Nova déclenchent involontairement un Sharkado mondial qui frappe successivement les plus grandes villes du monde : Londres, Rio de Janeiro, Rome, Tokyo... Leur fils Gil ayant été aspiré par la tornade à Londres, Fin et sa femme April la poursuivent à travers le monde, pour tenter de sauver leur fils et empêcher la fin du monde.
Fin et April passent leurs vacances d'été en Floride. Pas de chance ! Cet État, habituellement ensoleillé, est détrempé par la pluie. Mais il y a pire : un Sharknado s'annonce. C'est toute la côte Est, d'Orlando à Washington, qui cette fois-ci sert de garde-manger aux requins volants. Fin et April vont devoir, une fois de plus, sortir le grand jeu.
Le Sharktopus est de retour sur ses meurtres contre l'humanité dans la ville. Entre-temps, une scientifique crée un hybride mi-loup mi-orque, le Whalewolf, qui va aussi commettre des meurtres dans la ville. Il y aura une lutte sans merci entre les deux hybrides.
A tugboat pulling a huge iceberg arrives at a port in Alexandria, Egypt, when suddenly, the iceberg shatters and releases a megalodon from suspended animation. The Mega Shark begins its reign of terror by flipping the tugboat to the air until it crashes and decapitates the Sphinx hundreds of miles away in Giza. Following the incident, several countries around the world place their ports on lockdown and impose a ban on fishing, adversely affecting the world's economy as the megalodon terrorizes the seas. Meanwhile, rumors surface of the United Nations' proposal to develop a weapon to combat the shark.
After a snowboarder inadvertently starts a major avalanche, the moving snowfield uncovers and wakes a prehistoric "snow shark" which had been trapped beneath. The shark develops an appetite for human flesh and the staff at the Twin Pines Ski Resort begins getting reports of missing people and strange finned creatures moving under the snow. Fearing financial loss on what is their busiest event day of the year, the Bikini Snow Day, the Twin Pines management tries to hide news of the missing skiers and sightings of strange creatures. Disaster strikes as the bikini-clad snow bunnies one-by-one become meals for the shark. The avalanche has cut off the roads trapping all within the Twin Pines Valley. The local sheriff allies with snowboarders to track down the monster.
Fin Shepard and his ex-wife April Wexler are flying to New York City to promote How to Survive a Sharknado and Other Unnatural Disasters, a book April has written about the Los Angeles sharknado. As the plane comes in for a landing through a storm, it is battered by airborne sharks, losing an engine. Sharks enter the plane, killing passengers and crew, including both pilots. While Fin successfully lands the plane, April's hand is bitten off by a shark while she attempts to shoot it with an air marshal's handgun.